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APG IV系統(tǒng)學(xué)習(xí)筆記分享(一)

媒體:原創(chuàng)  作者:王康
專業(yè)號:王康 2020/3/12 13:29:59

第一章  緒  論

一、什么是被子植物APG系統(tǒng)?

APG系統(tǒng),也稱為APG分類法,是指被子植物系統(tǒng)發(fā)育研究組(Angiosperm Phylogeny Group)以分支分類學(xué)和分子系統(tǒng)學(xué)為研究方法提出的被子植物分類系統(tǒng)。 自1998年首次提出APG I之后,2003年發(fā)布了APG II,2009年發(fā)布了APG III,2016年發(fā)布了APG IV。

二、APG系統(tǒng)與其它植物分類系統(tǒng)有什么區(qū)別?

千百年來,人們不斷地對身邊的植物加深著了解,當(dāng)種類越來越多的時候,就要把植物的物種分清楚,并且要分門別類地記錄下來,這個時候就需要植物分類系統(tǒng),同時也就有了植物分類學(xué)家。

世界上所有的植物分類學(xué)家都希望建立一個理想的分類系統(tǒng)。在這個系統(tǒng)里,按照植物在地球出現(xiàn)的順序來擺放,親緣關(guān)系近的放在一起,就好像有一棵生命樹,枝條頂端的葉片就好像是一個個物種,小枝條把葉片集中在一起,大枝條又把小枝條集中在一起,最后主干把所有的大枝條集中在一個根基上。然而,繪制生命樹這件事情說起來容易,做起來可就太難了。

長久以來,植物學(xué)家們主要通過觀察、實(shí)驗(yàn)和統(tǒng)計的方法,依據(jù)植物形態(tài)特征的不同劃分物種,并根據(jù)重要特征的進(jìn)化先后順序把植物按照界、門、綱、目、科、屬、種的等級,繪制出一幅幅看上去彼此都很像的生命樹,但是仔細(xì)觀察以后,很多細(xì)節(jié)非常迥異。

這是為什么呢?因?yàn)橹参锓诸悓W(xué)家們的觀點(diǎn)不一樣。有時候,不同的植物學(xué)家根據(jù)不同的形態(tài)特征來規(guī)劃自己的生命樹,這就好比都是畫工筆的兩位畫家,一個畫魚鳥,另一個畫花草;有時候,一個特征在某些植物學(xué)家的眼里是進(jìn)化的,而在另一些植物學(xué)家的眼里卻是原始的,這就好比畫油畫的碰到了畫水墨的,畫風(fēng)不一樣。于是,在人世間就出現(xiàn)了很多的植物分類系統(tǒng)。其中,有的非常接近,而有的就相差甚遠(yuǎn)。

但是隨著時間的推移,到了近代,由于科學(xué)技術(shù)的迅速發(fā)展,植物學(xué)研究也日新月異,很多植物分類系統(tǒng)不斷得到修正,趨同的方向日益明顯。當(dāng)迅猛發(fā)展的分子生物學(xué)出現(xiàn)時,植物分子系統(tǒng)學(xué)大有一統(tǒng)天下之勢。

植物分子系統(tǒng)學(xué)利用生物大分子,如蛋白質(zhì)和核酸(包括DNA和RNA),主要是核酸分子。核酸分子具有良好的遺傳穩(wěn)定性,上面的基因組帶有大量的遺傳信息,有些基因組,如葉綠體基因組(cpDNA),在分子水平上,既存在差異,又相對保守,這些數(shù)據(jù)非常有利于系統(tǒng)發(fā)育學(xué)研究,不僅可以區(qū)分由共同祖先帶來的同源性,還可以區(qū)分由于趨同進(jìn)化從不同祖先帶來的相似性。根據(jù)核酸分子或者蛋白質(zhì)分子數(shù)據(jù)繪制出的生命樹客觀性更強(qiáng)。

上面這段話有點(diǎn)不容易懂,我們換個通俗的說法來理解。長久以來,我們習(xí)慣于把外貌長得相像的物種放在一起,認(rèn)為它們的親緣關(guān)系比較接近,對于外貌長得大相徑庭的物種,則認(rèn)為親緣關(guān)系很遠(yuǎn);然而,在自然界里,總是有始料未及的現(xiàn)象:有時候,長得很像的植物之間親緣關(guān)系很遠(yuǎn);而相貌差異很大的植物卻系出同門。舉個例子,樸樹屬(Celtis)植物從形態(tài)特征上來看,與榆屬(Ulmus)、櫸屬(Zelkova)一起放在榆科(Ulmaceae)看上去再和諧不過了,然而,通過比對DNA序列,發(fā)現(xiàn)樸樹屬(Celtis)與大麻屬(Cannabis)、啤酒花屬(Humulus)親緣關(guān)系更近,放在大麻科(Cannabaceae)更自然,更客觀。

這就好比《楊家將》故事里替死的任炳和楊六郎相貌極為相似,卻與楊六郎沒有絲毫血緣關(guān)系;而佘太君生下的七、八個兒子中,相貌和性格都各不相同。這就是說,長得像的未必親緣關(guān)系就近,長得不像的也未必親緣關(guān)系就遠(yuǎn)。

這樣的例子在APG系統(tǒng)里并不少見,給習(xí)慣于原有分類系統(tǒng)的人們帶來很大的煩惱。有的人捶胸頓足,破口大罵APG沒有人性;有的人城府較深,仔細(xì)觀察,不發(fā)表任何言論,靜觀其變;有的人積極面對,逐漸開始學(xué)習(xí)、研究、了解,并開始在工作中運(yùn)用APG。

當(dāng)然,APG系統(tǒng)在發(fā)展的過程中,還會遇到很多困難和質(zhì)疑,但是,就目前的研究進(jìn)展來看,在目和科的水平上已經(jīng)趨于穩(wěn)定,基本框架已經(jīng)成熟,將來的困難主要集中在某些奇葩科里的某些奇葩屬的水平上了,總體上來說,已經(jīng)確定了一統(tǒng)天下的大勢所趨。

三、為什么要學(xué)習(xí)APG系統(tǒng)?

現(xiàn)在國內(nèi)對于APG系統(tǒng)的認(rèn)識還在初始階段,但是歐美一些大學(xué)植物分類課程本的科教材中已經(jīng)普遍使用APG系統(tǒng),很多植物園的牌示系統(tǒng)正在更換中,后臺的植物登記數(shù)據(jù)庫也正在更換為APG系統(tǒng)。因此,現(xiàn)在或者將來打算從事農(nóng)林牧漁、園林園藝、醫(yī)學(xué)醫(yī)藥等生物類學(xué)科的小伙伴們就要抓緊時間跟上步伐,以免將來后悔莫及。

四、本系列文章適合怎樣的人群閱讀?

本系列文章將有若干篇持續(xù)連載,完全是筆者本人的學(xué)習(xí)筆記,這里與大家分享,共同學(xué)習(xí)。歡迎專家拍磚和愛好者拋玉討論,大家一起成長。主要適合人群如下:

植物愛好者、花友,植物分類知識欠缺的;

植物工作者,但非植物分類專業(yè)研究者;

家長朋友們,尤其是家里有小朋友喜歡植物的;

大學(xué)里樹木學(xué)、花卉學(xué)、植物學(xué)70分以下的;

農(nóng)林專業(yè)畢業(yè)的、從事行政工作2年以上的;

等等。

只要您愿意的,都可以了解并與周圍的人分享。只有那些捶胸頓足,破口大罵APG沒有人性的人,請慎入。

好,先上一個圖,這就是APG IV系統(tǒng)里被子植物的基本類群,包括:ANA基部群、木蘭類、金粟蘭目、單子葉植物、金魚藻目、真雙子葉植物。

是的,讓我們從最簡單的開始。可是,有的人會說,怎么看上去有點(diǎn)亂呢?對,是有點(diǎn)亂,這也就是我們要下回分解的內(nèi)容。

今天就到這里,休息,休息一下。

(未完待續(xù)........)

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